Los fallos quedan registrados, y pueden ser temporales o permanentes. Si había muchos, podrían haberse debido a problemas eléctricos puntuales, como una batería en mal estado que no entrega suficiente voltaje/corriente y los módulos de vuelven locos. Luego cambian la batería y se soluciona, pero quedan registrados. También podría ser por el alternador. ¿Han cambiado batería o alternador en alguna ocasión?
Si hicieras un diagnóstico con VIDA+DICE podrías leer más cosas, centralita por centralita y borrarlos todos de golpe para después repetir diagnóstico. También podrías hacerlo con una máquina de diagnóstico profesional, pero la mejor es VIDA+DICE.
Sobre la EGR, con la rebaja de precio podrías asumir la sustitución, aunque yo previamente la mandaría desmontar y limpiar. No me plantearía anularla, porque en esos modelos, según recuerdo haber leído, daba fallo y entraba en modo protección. Seguidamente, le echaría un bote de Xenum In&Out Diesel para limpieza de inyectores, escape, turbo, FAP... y opciónalmente, limpieza con oxiortnoseque... que están tan de moda y ofrece Buenos resultados.